Głównym miejscem syntezy glutationu (GSH) są komórki wątroby, gdzie odbywa się wytwarzanie cysteiny z wykorzystaniem metioniny jako źródła siarki.
Cysteina potrzebna do syntezy glutationu pochodzi również z reakcji redukcji cystyny.
Synteza glutationu zachodzi w cytosolu i obejmuje dwie reakcje:
W warunkach fizjologicznych parametrem limitującym szybkość powyższej reakcji jest dostępność cysteiny i jej prekursora cystyny. Glutaminian i glutamina, występujące w dużym nadmiarze w stosunku do cysteiny nie są czynnikami ograniczającymi szybkość syntezy glutaminocysteiny.
Dysmutaza ponadtlenkowa (SOD) katalizuje reakcję dysmutacji dwóch cząsteczek anionorodnika ponadtlenkowego (O2-•) do tlenu cząsteczkowego (O2) i nadtlenku wodoru (H2O2) rozkładanego następnie przez katalazy i peroksydazy, przez co stanowią główny element tzw. „pierwszej linii obrony” komórki przed nadmiarem reaktywnych form tlenu (RFT).
Peroksydaza glutationowa (GPx) wraz z glutationem oraz katalazą uczestniczą w usuwaniu szkodliwego nadtlenku wodoru w wyniku czego powstaje nieszkodliwy tlen cząsteczkowy oraz H2O, a także glutation w formie utlenionej (GSSG). Ten ostatni w wyniku działania gammaglutamylotranspeptydazy rozpada się na cysteinę, glicynę i glutaminę, które ponownie mogą być resorbowane i używane do biosyntezy glutationu.
Powstały nadtlenek wodoru bierze udział również w reakcji Fentona, czyli reakcji z jonem żelaza (ll) (Fe2+ ) w wyniku której powstaje rodnik hydroksylowy(OH•).
Rodniki hydroksylowe reagują ze związkami organicznymi (R-H) przez oderwanie atomu wodoru w wyniku czego powstaje rodnik alkilowy (R•) oraz cząsteczka wody.